#!/bin/bash
# 统一修改处：把下面一行换成你需要的受试者名即可
SUBJECT="CHEN-REN-GENG_sag_linear"

# python check_gpu.py

# 第一阶段：执行到分割掩膜移动
# python auto_pipeline.py \
#     --subjects "$SUBJECT" \
#     --config pipeline_config.json \
#     --device gpu:3 \
#     --steps create_dirs move_predictions normalize segment move_masks

# 第二阶段：分割完成后，创建参考文件配置
# 手动创建 reference_config_template.json

# 第三阶段：移动参考文件并计算指标
# 注意：如果你的 reference 阶段也需要同一个变量，保持 "$SUBJECT"；
# 如果实际要用 CHEN-REN-GENG_tra，请再声明一个变量，例如 SUBJECT_REF="CHEN-REN-GENG_tra"
python auto_pipeline.py \
    --subjects "$SUBJECT" \
    --reference-config reference_config.json \
    --steps move_reference metrics